Itaka-Escolapios es una organización creada e impulsada por los Escolapios y por sus Fraternidades, que pese a que legalmente se constituye como fundación en el año 2001 recoge el trabajo que, en materia de educación en el tiempo libre, educación para la paz, cooperación internacional y acción social desarrollaban en Bilbao diversas asociaciones del entorno desde comienzos de los años 80. 

Cabe destacar entre todas las actividades iniciales el Grupo scout Mikel Deuna, germen del Movimiento Calasanz actual, los grupos universitarios que configuraron el catecumenado hoy presente en Itaka-Escolapios y la Escuela de Formación de Tiempo Libre “Iturralde”.

El trabajo continuado con menores de diferentes centros de Bilbao y de otros municipios de Bizkaia desemboca en el año 1995 en la puesta en marcha de un hogar para mujeres jóvenes que abandonaban los sistemas de protección y tenían que retornar en muchas ocasiones a los hogares de donde habían salido en su infancia. El buen funcionamiento del hogar y la demanda de nuevas plazas hace que el año 1997 se abra el segundo de los hogares. El perfil de las personas participantes ha ido cambiando a lo largo de los años para culminar en el 2001 con la creación del programa Beregain, que sigue presente en Itaka-Escolapios hoy en día.  

A los hogares para mujeres gestantes se une en 2007 Aukera, que ha ido creciendo en cuanto al número de personas participantes e incidencia en Bilbao, constituyéndose en el Programa de Acompañamiento a Personas Migrantes. Programa que incorporará en el año 2010 el aprendizaje de español, Ojalá, tras una solicitud del Ayuntamiento de Bilbao.

La alianza entre el Colegio Escolapios y la Fundación Itaka-Escolapios en Bilbao siguen actualizando los pasos de San José de Calasanz impulsando la evangelización y la acción educativa y social.